广东省农业科学院水稻研讨所研讨员刘琦团队联合中国林业科学研讨院副研讨员丁昌俊团队、四川大学教授曹毅团队在植物核糖核酸(RNA)润饰数据库渠道助力植物RNA润饰研讨方面获得新发展。近来,相关效果在线发表于《核酸研讨》。
近年来,形式植物体系中RNA润饰的规模和功用已成为研讨的热门,但是,现在缺少一个数据库渠道可以对植物RNA润饰及其相关调控数据来进行全面发掘、注释和可视化。
研讨团队经过搜集、收拾和剖析20种植物物种RNA大数据,开发了植物RNA润饰归纳数据库(PRMD)。研讨人员表明,PRMD对用户完全免费敞开,后续版别中将进一步增加和完善不同植物物种的不一样的品种RNA润饰数据。
据介绍,该数据库不只供给了一种直观显现信息的届面,还供给了RMlevelDiff、RMplantVar、RNAmodNet和Blast等多种可视化和功用剖析东西,而且经过mRNAbrowse、RNAlollipop、JBrowse和Integrative Genomics Viewer等可视化届面能明晰显现相关的剖析和计算成果。一起,研讨团队使用数据库对水稻驯化中RNA的润饰效果进行了深入探讨。
上述研讨得到广东省农业科学院生物育种中心协同立异项目、国家自然科学基金和林木遗传育种国家重点研制项目等项目的赞助。